上海市儿童医院泌尿外科是上海市交通大学“先天性泌尿生殖系畸形外科诊治中心”。牵头联合各单位进行了“新生儿严重泌尿系统畸形规范化诊治的多中心临床研究”等多项多中心的临床研究。近几年相继获得了上海市优秀学科带头人计划、上海市曙光计划以及上海市医学领军人才计划等多项科研项目资助。连续5 年主办国家级医学继续教育培训“儿童尿道下裂个体化诊治与进展学习班暨中国尿道下裂论坛”，协办并参与国内外多次学术会议及活动。现有博导1 名，硕导1 名。主任医师2 名，副主任医师3 名，主治及住院医师6 名。目前承担着国家自然科学基金、上海市科委、上海市卫计委等国家级与市局级科研课题7 项；2015 年发表SCI论文2 篇，核心期刊论文2 篇。2015 年度门急诊人数超过29725 人次，现有核定床位36 张，住院手术人数超过3500 人次。是目前国内唯一可以开展达芬奇机器人辅助手术的小儿泌尿外科团队，目前已成功完成20 余例。2015 年派送国外交流访问的医师3 人，参加国内外学术交流会议达19 次，大会发言6 篇。完成培养博士研究生1 名，目前尚在培养博士研究生2 名，硕士研究生3 名。